什么会有如此众多的海洋生物呢？
贝加尔湖是淡水湖，但却生活着许多地地道道的海洋生物，海豹、海螺、海鱼和龙虾。 又如贝加尔湖里长有热带的生物，像贝加尔湖藓虫类动物，其近亲就生活在印度的湖泊里，贝加尔湖水蛭在我国南方淡水湖里才能见到，贝加尔湖蛤子，只生存在巴尔干半岛的奥克里德湖。
最初的时候，一些科学家认为，地质史上贝加尔湖是和大海相连的，海洋生物是从古代的海洋进入贝加尔湖的。前苏联科学家维列夏金认为，这是地壳变动的结果。他根据古生物和地质方面的材料推测，中生代侏罗纪时的贝加尔湖以东地区，曾有过一个浩瀚的外贝加尔海。
后来由于地壳变动，留下了内陆湖泊——贝加尔湖。随着雨水、河水的不断加入，咸水变淡，而现在的“海洋生物”就是当时海退时遗留下来的。 上个世纪50年代初期，人们在贝加尔湖附近打了几口很深的钻井。但从取上来的岩芯样品中，人们没有发现任何关于中生代的东西。
也有一些材料证明，没有中生代的沉积层，只有新生代的沉积岩层。贝加尔湖地区长时间以来一直是陆地。贝加尔湖是在地壳断裂活动中形成的断层湖，从而否定了湖中海洋生物是海退遗种的说法。 到现在也不知道贝加尔湖里的海洋生物哪里来的。 贝加尔湖湖水为低矿化度、贫营养的中性淡水，属于水质最好的一类水，尤其春天时水中生物较少，湖水呈现蓝色，透明度最深可以达到40米，位列世界第二。
