不请自来。这个问题并不是很难说清楚。
自《钢铁侠3》后托尼胸口的反应堆已经不再是保命的必须装备了，在之后的故事线中，反应堆还是在原来的位置，只是给战甲供能的需要和自己的习惯而已为什么这么说呢，首先我们需要梳理下，题主的问题里涉及的故事线顺序。托尼由一个职业军火商转变成一个行侠仗义的钢铁侠是从《钢铁侠》开始的，然后历经《钢铁侠2》万科的复仇，再到加入神盾局的复仇者计划，参与了《复仇者联盟》中的纽约大战。而《钢铁侠3》就是纽约大战之后钢铁侠托尼个人的故事情节了，其中贯穿整部影片的托尼战后抑郁症，还有就是和小辣椒的感情故事了。
所以理所当然的，托尼接受手术摘除了一直威胁自己生命的导弹碎片和为维持生命的胸口微型反应堆。《钢铁侠》中钢铁侠的诞生，其中就是主要阐述托尼是如何一步一步转变为超级英雄的，当然最主要的还是交代了胸口微型反应堆的由来。
由于受伤于自己研发的导弹，身体中被摄入大量的导弹碎片，而这些碎片又会随着血液不断的向心脏汇聚，为了延续自己生命，托尼才被安上了一个类似磁铁的装置，在两侧肋骨之间的胸腔位置，为了吸附阻止弹片流入心脏。
起初绑架团伙给托尼安装的装置是依靠汽车电瓶来供能的，但托尼却突发奇想的利用废旧原料缩小了父亲留下来的反应堆，以此来供能，这也为托尼摆脱困境，发明马克1号提供了能量支持。
既然在《钢铁侠3》中，托尼为了安抚小辣椒的感受，在解决末日病毒的危机后，毅然的启动了“末日派对”，将自己的马克大军都用来放烟花哄小辣椒开心了。（此处雨哥觉得相当败家，不要可以送我嘛）危机之后也更是毅然的接受了中国的医疗援助，手术取出了全部威胁了自己多年的弹片，当然还有胸口的微型反应堆了。
那么问题来了，既然都已经取出来了，那么在之后的《复仇者联盟2》和《复仇者联盟3》中，托尼胸口的反应堆还在呢？雨哥个人觉得有以下几种可能。
习惯使然要知道从《钢铁侠》到《钢铁侠2》，再到《复仇者联盟》，最后到《钢铁侠3》，看似时间没多久，可在影片的中的托尼，可是相当长的一段时间，从马克1一直到《钢铁侠3》中的马克大军，可想这需要多少时间才能完成。而在此期间，反应堆一会作为托尼耐以生存的救命神器，早已习惯了它的存在，更何况在《钢铁侠》中，小辣椒曾将一代淘汰的反应堆比作是托尼的心，并一次作为礼物送还给托尼，也机缘巧合下的拯救了托尼，缓解了《钢铁侠》中的危机。
可想无论出于是自己的依赖习惯，还是微型反应堆自身被附有的一些深层次含义，这些都会使托尼更习惯的将微型反应堆还放在原来的位置。
技术限制要知道托尼发明的反战争机甲，反而是当时世界上最厉害的战争武器，可以说领先世界其他国家几十年。其中的技术难关，不言而喻。当然我们从《钢铁侠》还有之后的系列中，托尼调试和研发的细节中，也不难发现其机甲的精密程度。而之后随着马克系列不断的更新升级，其功能也是越来越强大。
越来越强大的战甲，越来越小的体积，可想其技术难关。从初代的马克设计，微型反应堆一直就在胸口位置，并且之后的马克3以后，胸口的反应堆更是一个主要的能量爆冲的攻击手段。想要兼顾其他功能，转换反应堆的位置并不会很容易的。多所以这也可能是托尼之后反应堆还在胸口的一个原因之一。
自恋
《钢铁侠2》中黑寡妇对于托尼的一份评估报告中，就评价托尼是一个不折不扣的超级自恋狂，托尼对此也是无比乐于承认的。在《钢铁侠3》中，托尼向小男孩证明自己身份时，一个是通过没电的盔甲，另一个就是胸口的反应堆了。可以见得，钢铁侠战甲和胸口的反应堆已经成为托尼的一个身份证明和象征了。
如此看来，超级自恋狂的托尼将闪闪发光的反应堆继续拜访在显眼的胸口，招摇过市也就不足为奇了吧。
另有他用
还有一点比较最重要的是，对于只是一个富有才华的正常人类，没有战甲的托尼，是相当脆弱的，始终的佩戴者反应堆或是战甲，对于缺乏安全感的托尼也是无奈之举。
更何况在《复仇者联盟3》中，反应堆已经不再是单一的能量装置了，新一代的马克50纳米战甲，胸口的反应堆更是一个纳米材料的收纳装置，对于这点也是托尼亲口显摆说出来的。这也更使得反应堆变得更加的重要，摆在触手可及的胸口，以便随时可以进入战斗状态，对于托尼来说就无可厚非了。
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